مدولاربودن در شبکههای بیولوژیکی
چکیده: مدلسازی شبکهای، از مقیاس اکولوژیکی تا مولکولی، به یک ابزار اصلی برای مطالعه ساختار، رفتار دینامیکی و پیچیده سیستمهای زنده تبدیل شده است. نمایش گرافی روابط بین مولفههای بیولوژیکی، انواع گستردهای از روشهای مکانیکی و عملکردی سیستمهای بیولوژیکی را فراهم آورده است. بسیاری از شبکههای بیولوژیکی به صورت یک ساختار مولکولی سازماندهی شدند، بنابراین اگر بخواهیم سیستم بیولوژیکی را به عنوان یک کل درک کنیم، روشهای کشف چنین ماژولهایی ضروری هستند. با این حال، اغلب روشهایی که به این منظور در بیولوژی استفاده میشوند، قابلیت اجرایی محدودی دارند چرا که آنها بسیار خاص هستند برای همان سیستمی که برایش توسعه یافتهاند. برعکس، مدولاربودن گراف از منظر فیزیک آماری و علم شبکه، به صورت تئوری مطالعه و چندین روش با ماهیت بسیار کلی، توسعه داده شده است. چشمانداز ما این است که بیولوژی و فیزیک نظری/ علم شبکه، بهویژه درخصوص مساله تشخیص مدولاربودن، کمتر از آن چیزی که باید، با هم مرتبط هستند. هدف اصلی این مطالعه، فراهمآوردن پیشزمینه لازم و معرفی روشهای اجراییتر و مرتبطتر برای تشخیص جامعه، به روشی است که برای کاربرد بیشتر آنها در پژوهش بیولوژیکی، ایجاد انگیزه نماید.
کلمات کلیدی: مدولاربودن، ساختار جامعه، موتیفها، شبکههای بیولوژیکی، بیولوژی سیستمها.