علمدار مبارزه با بهاییان پیش از بازگشت شهید صدوقی به یزد، بهاییان قدرت زیادی یافته و پست‌های کلیدی برخی از نهادها را در اختیار گرفته بودند. آنان چنان جسور شده بودند که شبانه با بیل و کلنگ به جان یک خانواده شیعه ابرکوهی افتاده و سر آنان را قطعه‌قطعه کردند. البته این ماجرا با پیگیری آیت‌الله سید ابوالقاسم کاشانی به محکوم شدن آنان منجر شد. بهاییان ساکن یزد، مبلغان دینی را در مسیر برگزاری مراسم عزاداری سالار شهیدان می‌ربودند. به عنوان نمونه، آنان مرحوم حاج شیخ غلام‌رضا یزدی را چند بار ربودند؛ که با تلاش‌های مرحوم وزیری ایشان آزاد شد. پس از بازگشت شهید صدوقی به یزد روزگار بهاییان سیاه و بسیار محدود شدند. اما کوتاه کردن دست بهاییان توسط ایشان، به استان یزد محدود نشد و ایشان حرکات آنان را در استان‌های همجوار نیز رصد کرده و آنان را محدود ساخت. برای نمونه، زمانی که بهائیان تصمیم گرفتند تا با خرید خانه‌های اطراف خانه علی‌محمد باب، مركز بزرگی برای تبلیغات فرقه گمراه خود در شیراز به وجود آورند، ایشان برای درهم شكستن این توطئه خانه‌ای مناسب را در همان محله به قیمت گزافی خرید و به مدرسه علمیه‌ تبدیل كرده و آنان را در نیت شوم خود ناکام گذاشت. @maosya