🌎 با لمس لینک ایتا با ما در کانال تحلیل دادههای زیستی همراه باشید:
Eitaa: https://eitaa.com/biodataanalysis
DataAnalysis-0073-14041208
هدایت شده از دنیای گاو شیری
قرآن کریم
مِنَ الْمُؤْمِنِينَ رِجَالٌ صَدَقُوا مَا عَاهَدُوا اللَّهَ عَلَيْهِ فَمِنْهُمْ مَنْ قَضَىٰ نَحْبَهُ وَمِنْهُمْ مَنْ يَنْتَظِرُ وَمَا بَدَّلُوا تَبْدِيلًا
از مؤمنان مردانی هستند که به آنچه با خدا بر آن پیمان بستند، صادقانه وفا کردند، برخی از آنان پیمانشان را به انجام رساندند، و برخی از آنان در انتظارند و هیچ تغییر و تبدیلی (در پیمانشان) ندادهاند.
قران کریم سوره احزاب
هدایت شده از دنیای گاو شیری
تماشا آنلاین سریال بادار | تلوبیون
https://telewebion.ir/product/0xc5cfcbe
سریال بادار در سالهای 1403 و 1404 ساخته شد. این سریال منعکسکننده بخشی از فعالیتهای صورت گرفته در پروژه احیای گاو سیستانی است که با سرمایه گذاری شرکت زرژن البرز و حمایت ستاد توسعه زیست فناوری و معاونت علمی فناوری ریاست جمهوری در منطقه سیستان، استان تهران و استان اصفهان اجرا شد.
گاو سیستانی یک سرمایه ملی است و در سال های اخیر به شدت جمعیت آن کاهش یافته و در معرض انقراص قرار گرفته است.
🌎 با لمس لینک ایتا، با ما در دنیای گاو شیری همراه باشید:
Eitaa: https://eitaa.com/dairyworld
C-0153-Beef-14050209
بیوانفورماتیک
🧬🔬 ا Multi-Omics در بیوانفورماتیک
📘 عنوان: Multi-Omics؛ تحلیل همزمان ژنوم، ترنسکریپتوم، پروتئوم و متابولوم برای درک جامع سیستمهای زیستی
🔍 تعریف مفهومی: Multi-Omics به ادغام و تحلیل همزمان چندین لایه دادهای Omics گفته میشود: ژنومیک، اپیژنتیک، ترنسکریپتومیک، پروتئومیک، متابولومیک و حتی فنومیکس.
📖 به زبان ساده:
اگر هر Omics مثل یک پنجره به بخشی از سیستم زیستی باشد، Multi-Omics مجموعه این پنجرههاست که تصویر کامل و سهبعدی از سلول، بافت یا ارگانیسم ارائه میدهد 🌐🧠.
🧠 اهداف اصلی Multi-Omics:
1️⃣ درک تعاملات پیچیده بین ژنها، پروتئینها، متابولیتها و فنوتیپها
2️⃣ کشف مسیرهای مولکولی مرتبط با بیماریها و پاسخ دارویی
3️⃣ شناسایی بیومارکرهای دقیق برای پزشکی شخصیسازیشده
4️⃣ مدلسازی سیستمهای زیستی و شبکههای مولکولی
⚙️ لایههای Multi-Omics:
🔹 Genomics – توالییابی DNA و شناسایی جهشها
🔹لایه Epigenomics – متیلاسیون DNA و تغییرات کروماتین
🔹 لایه Transcriptomics – تحلیل بیان ژنها (RNA-Seq, scRNA-Seq)
🔹 لایه Proteomics – پروتئینها، پروتئوم و تعاملات پروتئینی
🔹 لایه Metabolomics – متابولیتها و مسیرهای متابولیکی
🔹لایه Phenomics – صفات قابل اندازهگیری ارگانیسمها
💻 ابزارها و پلتفرمهای کلیدی:
🔹 MixOmics – ادغام دادههای چند Omics در R
🔹 Cytoscape + OmicsNet – تحلیل شبکههای مولکولی چندلایهای
🔹 MetaboAnalyst – تحلیل دادههای متابولومیک و ترکیب با سایر Omics
🔹 iCluster / MOFA – مدلسازی دادههای چند-Omics برای خوشهبندی و پیشبینی
🔗 منابع:
• https://www.mixomics.org/
• https://www.metaboanalyst.ca/
• https://www.omicsnet.ca/
🧪 کاربردهای Multi-Omics:
1️⃣ پزشکی شخصیسازیشده
• شناسایی مسیرهای مولکولی و بیومارکرهای پیشبینیکننده پاسخ دارویی 🧬💊
2️⃣ مطالعات سرطان و بیماریهای مزمن
• ادغام دادههای ژنومیک، پروتئومیک و متابولومیک برای درک مسیرهای بیماری 🧪
3️⃣ بیوتکنولوژی و زیستفناوری صنعتی
• بهینهسازی مسیرهای متابولیک و طراحی میکروبها یا گیاهان مهندسیشده ⚗️🌱
4️⃣ کشاورزی و دامپروری دقیق
• تحلیل رشد، تولید و مقاومت حیوانات و گیاهان از طریق دادههای Multi-Omics 🐄🌾
📈 مزایا و اهمیت:
• امکان تحلیل سیستمهای پیچیده بهصورت جامع
• شناسایی تعاملات ژن-پروتئین-متابولیت
• پشتیبانی از تصمیمگیری بالینی و تحقیقاتی دقیقتر
• پیشبینی پاسخ فردی به دارو، محیط یا تغذیه
💬 جمعبندی:
Multi-Omics پلی بین دادههای مولکولی، شبکههای سلولی و فنوتایپها است.
با این روش، پژوهشگران قادرند سیستمهای زیستی را بهصورت کلنگر و دقیق مدلسازی کنند و مسیرهای درمانی و زیستفناورانه نوین طراحی کنند 🌐🧬💡.
📚
#MultiOmics #Bioinformatics #SystemsBiology #Genomics #Proteomics #Metabolomics #Transcriptomics #Phenomics #NetworkBiology #PrecisionMedicine
🌎 با لمس لینک ایتا با ما در کانال تحلیل دادههای زیستی همراه باشید:
Eitaa: https://eitaa.com/biodataanalysis
DataAnalysis-0074-14050215
اصلاح نژاد دام
📢 دوره آنلاین آمار بیزی و MCMC در اصلاح نژاد دام
⏰ زمان برگزاری: ۱۵ تا ۱۹ ژوئن ۲۰۲۶ (۲۶ تا ۳۰ خرداد ۱۴۰۵)، ساعت ۱۵ تا ۱۹ به وقت اسپانیا (والنسیا)
🧑🏫 مدرسین:
- آگوستین بلاسکو (تئوری)
- مارینا مارتینس آلوارو (حل تمرین)
🔹 سرفصلهای دوره:
✔️ مرور روشهای کلاسیک آمار استنباطی و بررسی نقاط ضعف آنها
✔️ مزایای استنباط بیزی و ارزیابی عدم قطعیت با استفاده از احتمالات
✔️ مفاهیم جدید: احتمال ارتباط، احتمال مشابهت، و حداقل مقدار تضمینشده
✔️ مقایسه آسان تیمارها به صورت نسبت (به جای تفاوت) در چارچوب MCMC
✔️ روشهای MCMC به صورت شهودی و کاربرد آنها در مدلهای خطی:
- برآورد اثرات ثابت
- پیشبینی ارزشهای اصلاحی
- برآورد مؤلفههای واریانس و پارامترهای ژنتیکی
✔️ مباحث پیشرفته: مدلهای سلسلهمراتبی، ژنتیک ناپایداری محیطی، تجزیه و تحلیل دادههای انتخاب شده، و «الفبای بیزی»
✔️ مسئله توزیع پیشین (Prior probability)
✔️ تکنیکهای انتخاب مدل: آزمون نسبت درستنمایی، فاکتور بیز، AIC، BIC، DIC
🔹 نرمافزار مورد نیاز:
نرمافزار عمومی و نرمافزار تهیهشده توسط مدرسین برای تمرینهای عملی استفاده میشود.
اگرچه آشنایی با R الزامی نیست، اما نصب نسخه R 4.3.2 یا جدیدتر روی لپتاپ شرکتکنندگان ضروری است.
🔹 منابع دوره:
کتاب «تحلیل دادههای بیزی برای دانشمندان علوم دامی» (نوشته آگوستین بلاسکو، انتشارات اشپرینگر، ۲۰۱۷) به همراه جزوه و مقالات بحثمحور ارائه خواهد شد.
📄 برای مشاهده رزومه کوتاه استاد بلاسکو:
https://dca.webs.upv.es/dcia/ablasco/curri.htm
🌐 اطلاعات بیشتر و ثبتنام:
با توجه به عدم دسترسی موقت به لینک اصلی، احتمالاً صفحه دوره بهزودی فعال خواهد شد. جهت کسب اطلاعات بیشتر میتوانید با استاد بلاسکو تماس بگیرید:
Agustin Blasco
Professor of Animal Breeding and Genetics
Institute for Animal Science and Technology
Universitat Polit=E8cnica de Val=E8ncia
P.O. Box 22012. Valencia 46022. Spain
Phone: +34 630157450
Web: http://dca.webs.upv.es/dcia/ablasco
#آمار_بیزی #MCMC #اصلاح_نژاد_دام #دوره_آنلاین #دانشگاه_پلیتکنیک_والنسیا #علوم_دامی
🌎 با لمس لینک ایتا با ما در کانال تحلیل دادههای زیستی همراه باشید:
Eitaa: https://eitaa.com/biodataanalysis
DataAnalysis-0075-14050215
پایگاه دادهها
📢 بهروزرسانی بزرگ پایگاههای داده ژنوم حیوانات (NAGRP)
📆 اردیبهشت ۱۴۰۵ - شماره ۲ از ۲۰۲۶
🧬 گروه بیوانفورماتیک NAGRP جدیدترین انتشارات خود را اعلام کرد:
🐄 ۱. انتشار نسخه ۵۹ پایگاه QTLdb (مرتبط با صفات کمی)
📅 ۲۰ آوریل ۲۰۲۶ میلادی (۳۱ فروردین ۱۴۰۵)
🔹 ۷,۵۶۲ رکورد جدید QTL/ارتباطی به پایگاه اضافه شد:
🐂 گاو: ۵,۲۹۱
🐔 مرغ: ۱,۱۳۷
🐐 بز: ۳۲۲
🐖 خوک: ۱۷۳
🐑 گوسفند: ۶۳۹
📊 مجموع QTLهای ثبتشده تا امروز: ۳۱۸,۴۴۱ رکورد از ۳,۰۳۸ مقاله علمی.
🔗 https://www.animalgenome.org/QTLdb/
📊 ۲. انتشار نسخه ۲۷ پایگاه CorrDB (همبستگی و وراثتپذیری)
📅 ۲۱ آوریل ۲۰۲۶ (۱ اردیبهشت ۱۴۰۵)
➕ ۱,۷۸۵ داده همبستگی جدید
➕ ۲۷۷ داده وراثتپذیری جدید
🔗 https://www.animalgenome.org/CorrDB/
🧠 ۳. بهروزرسانی هستیشناسیها (Ontologies)
✅ VT (هستیشناسی صفات مهرهداران): ۱۳ نسخه جدید – ۴,۰۵۵ عبارت
✅ LBO (نژادهای دام): ۱,۱۴۲ عبارت
✅ LPT (صفات فرآورده دامی): ۵۲۱ عبارت
✅ CMO (اندازهگیری بالینی): بهروزرسانی از BioPortal
🔗 https://www.animalgenome.org/bioinfo/projects/
🗓 ۴. تقویم رویدادهای علمی جامعه
🔹 امکان مشاهده رویدادها به صورت نمایش تقویمی
🔹 ارسال رویداد جدید توسط کاربران
🔗 https://www.animalgenome.org/community/meetings/
🛠 تغییرات فنی مهم:
❌ چهار نقشه ژنومی قدیمی از لیست پشتیبانی QTLdb خارج شدند:
Btau4 (گاو)
GG4 (مرغ)
SS10 (خوک)
OAR3 (گوسفند)
✅ دادههای قدیمی همچنان به نقشههای پیشفرض جدید منتقل خواهند شد.
🧑💻 پشتیبانی مالی پروژه:
USDA-NIFA (کمک هزینه رقابتی شماره ۲۰۲۴-۶۷۰۱۶-۴۲۳۱۱)
پروژه چندایالتی NRSP8: ظرفیت ژنومی برای صنایع دامی
📬 تماس با تیم بیوانفورماتیک NAGRP:
✉️ bioinfo-team@animalgenome.org
🌐 https://www.animalgenome.org
#ژنوم_حیوانات #QTL #CorrDB #هستی_شناسی #NAGRP #NRSP8 #USDA #بیوانفورماتیک #دام_و_طیور #به_روزرسانی_علمی #ژنتیک_دام
🌎 با لمس لینک ایتا با ما در کانال تحلیل دادههای زیستی همراه باشید:
Eitaa: https://eitaa.com/biodataanalysis
DataAnalysis-0076-14050217
پایگاه دادهها
📢 بهروزرسانی بزرگ پایگاههای داده ژنوم حیوانات (NAGRP)
📆 اردیبهشت ۱۴۰۵ - شماره ۲ از ۲۰۲۶
🧬 گروه بیوانفورماتیک NAGRP جدیدترین انتشارات خود را اعلام کرد:
🐄 ۱. انتشار نسخه ۵۹ پایگاه QTLdb (مرتبط با صفات کمی)
📅 ۲۰ آوریل ۲۰۲۶ میلادی (۳۱ فروردین ۱۴۰۵)
🔹 ۷,۵۶۲ رکورد جدید QTL/ارتباطی به پایگاه اضافه شد:
🐂 گاو: ۵,۲۹۱
🐔 مرغ: ۱,۱۳۷
🐐 بز: ۳۲۲
🐖 خوک: ۱۷۳
🐑 گوسفند: ۶۳۹
📊 مجموع QTLهای ثبتشده تا امروز: ۳۱۸,۴۴۱ رکورد از ۳,۰۳۸ مقاله علمی.
🔗 https://www.animalgenome.org/QTLdb/
📊 ۲. انتشار نسخه ۲۷ پایگاه CorrDB (همبستگی و وراثتپذیری)
📅 ۲۱ آوریل ۲۰۲۶ (۱ اردیبهشت ۱۴۰۵)
➕ ۱,۷۸۵ داده همبستگی جدید
➕ ۲۷۷ داده وراثتپذیری جدید
🔗 https://www.animalgenome.org/CorrDB/
🧠 ۳. بهروزرسانی هستیشناسیها (Ontologies)
✅ VT (هستیشناسی صفات مهرهداران): ۱۳ نسخه جدید – ۴,۰۵۵ عبارت
✅ LBO (نژادهای دام): ۱,۱۴۲ عبارت
✅ LPT (صفات فرآورده دامی): ۵۲۱ عبارت
✅ CMO (اندازهگیری بالینی): بهروزرسانی از BioPortal
🔗 https://www.animalgenome.org/bioinfo/projects/
🗓 ۴. تقویم رویدادهای علمی جامعه
🔹 امکان مشاهده رویدادها به صورت نمایش تقویمی
🔹 ارسال رویداد جدید توسط کاربران
🔗 https://www.animalgenome.org/community/meetings/
🛠 تغییرات فنی مهم:
❌ چهار نقشه ژنومی قدیمی از لیست پشتیبانی QTLdb خارج شدند:
Btau4 (گاو)
GG4 (مرغ)
SS10 (خوک)
OAR3 (گوسفند)
✅ دادههای قدیمی همچنان به نقشههای پیشفرض جدید منتقل خواهند شد.
📬 تماس با تیم بیوانفورماتیک NAGRP:
✉️ bioinfo-team@animalgenome.org
🌐 https://www.animalgenome.org
#ژنوم_حیوانات #QTL #CorrDB #هستی_شناسی #NAGRP #NRSP8 #USDA #بیوانفورماتیک #دام_و_طیور #به_روزرسانی_علمی #ژنتیک_دام
🌎 با لمس لینک ایتا با ما در کانال تحلیل دادههای زیستی همراه باشید:
Eitaa: https://eitaa.com/biodataanalysis
DataAnalysis-0076-14050217
آموزش بیوانفورماتیک
به اطلاع شما میرسانم که مجموعهای از دورههای آنلاین فیزالیا (Physalia) در پیش است که ممکن است برای اعضای این جامعه در حوزههای ژنومیک، زیستشناسی تکاملی و بیوانفورماتیک کاربردی مورد توجه باشد. در ادامه، دورههای پیشرو در مه ۲۰۲۶ معرفی میشوند:
📅 دورهها:
۱️⃣ فراتحلیل در R
🗓 ۱۴–۱۱ مه
🔗 https://www.physalia-courses.org/courses-workshops/metain-r/
۲️⃣ آنالیز غنیسازی مجموعه ژن (GSEA) در R
🗓 ۱۵–۱۱ مه
🔗 https://www.physalia-courses.org/courses-workshops/gse-in-r/
۳️⃣ اومیکس فضایی با R/Bioconductor
🗓 ۲۰–۱۸ مه
🔗 https://www.physalia-courses.org/courses-workshops/spatial-omics-1
۴️⃣ مقدمه بر GWAS (مطالعات ارتباطی کل ژنوم)
🗓 ۲۲–۱۸ مه
🔗 https://www.physalia-courses.org/courses-workshops/course49/
۵️⃣ ژنومیک دریایی
🗓 ۲۹–۲۵ مه
🔗 https://www.physalia-courses.org/courses-workshops/marine-genomics/
۶️⃣ مدلهای خطی تعمیمیافته (GLM) در R
🗓 ۲۹–۲۵ مه
🔗 https://www.physalia-courses.org/courses-workshops/glm-in-r-1/
✨ ویژگی دورهها:
✅ همه دورهها عملی (hands-on) هستند
✅ تمرکز بر تحلیل دادههای واقعی
✅ آموزش توسط متخصصان بینالمللی
📢 اگر فکر میکنید این دورهها برای همکاران یا دانشجویان در شبکه شما مفید است، لطفاً این اطلاعات را به اشتراک بگذارید.
#دوره_آنلاین #ژنومیک #بیوانفورماتیک #R_GSEA #GWAS #اومیکس_فضایی #ژنومیک_دریایی #Physalia #آموزش_علمی #تحلیل_داده #تکامل #زیست_شناسی_محاسباتی
🌎 با لمس لینک ایتا با ما در کانال تحلیل دادههای زیستی همراه باشید:
Eitaa: https://eitaa.com/biodataanalysis
DataAnalysis-0077-14050215
پایگاه داده ها
پایگاه Human Cell Atlas | نقشه تکسلولی بدن انسان
🕒 زمان مطالعه: ۴ دقیقه
📌 موضوع: پروژه بینالمللی برای ترسیم نقشه جامع بیان ژن در تکتک سلولهای بدن انسان
پایگاه uman Cell Atlas (HCA) یک پروژه عظیم جهانی است که با هدف شناسایی، طبقهبندی و توصیف همه انواع سلولهای انسانی بر اساس ویژگیهای مولکولیشان طراحی شده است.
🔬 ویژگیها و اهداف کلیدی:
• استفاده از فناوریهای توالییابی RNA تکسلولی (scRNA-seq)
• بررسی بیان ژن، متیلاسیون، کروماتین و پروتئوم در سطح سلولی
• دستهبندی سلولها بر اساس بافت، رده سلولی، وضعیت رشد و بیماری
📚 این پروژه مشارکت بیش از ۲۵۰ مؤسسه از سراسر جهان را شامل میشود و تاکنون میلیونها سلول انسانی در بافتهایی نظیر مغز، ریه، خون، کبد، قلب و روده بررسی شدهاند.
🧠 کاربردها:
• درک بهتر از تمایز سلولی و تکوین بافتها
• شناسایی سلولهای نادر یا بیماریزا
• ایجاد مرجع بیولوژیکی برای طراحی درمانهای سلولمحور و ایمونوتراپی
🧪 دادهها بهصورت عمومی از طریق پورتال HCA قابل دسترسی و تحلیل هستند.
🔗 لینک رسمی: https://www.humancellatlas.org/
🎯 نتیجهگیری برای پژوهشگران:
HCA دریچهای نو برای درک دقیق ساختار سلولی بدن انسان است. پژوهشگران میتوانند از این پایگاه برای مطالعات بیولوژی توسعه، سرطان، بیماریهای نادر و طراحی درمانهای دقیق بهره بگیرند.
🏷 #HumanCellAtlas #scRNAseq #بیولوژی_سلول #تک_سلولی #بیوانفورماتیک_پیشرفته #Omics
🌎 با لمس لینک ایتا با ما در کانال تحلیل دادههای زیستی همراه باشید:
Eitaa: https://eitaa.com/biodataanalysis
DataAnalysis-0078-14050414